La ciencia abierta

Hoja de ruta

Leccion: 5 min
Prácticas: 5 min
Preguntas
  • ¿Cómo un control de versiones me puede ayudar a tener mi trabajo más abierto?

Objetivos
  • Explica como el control de versiones nos ayuda a tener un cuaderno electrónico para todo nuestro trabajo computacional.

Lo opuesto a “abierto” no es “cerrado”. Lo opuesto a “abierto” es “quebrado”.

— John Wilbanks

El libre intercambio de información podría ser el ideal en Ciencia. Pero la realidad, a menudo, es mucho más complicada. En la práctica cotidiana vemos situaciones como la siguiente:

Para muchos otros científicos, el proceso abierto se ve así:

Este modelo abierto acelera la investigación: el trabajo abierto se cita y se reutiliza. Sin embargo, las personas que quieren trabajar de esta manera necesitan tomar algunas decisiones sobre qué significa exactamente “abierto” y cómo hacerlo. Puedes encontrar más información sobre los diferentes aspectos de la Ciencia Abierta en el libro.

Ésta es una de las muchas razones por las que enseñamos el control de versiones. Cuando se utiliza con diligencia, responde a “cómo” actúa un cuaderno electrónico compartible:

Haciendo código citable

Esta breve guía de GitHub explica cómo crear un “Digital Object Identifier (DOI)” para tu código, tus artículos, o cualquier cosa alojada en un repositorio de control de versiones.

¿Cuán reproducible es mi trabajo?

Pide a un compañero de laboratorio que reproduzca un resultado que obtuviste utilizando sólo lo que está disponible en un documento publicado o en la web. Luego, trata de hacer lo mismo con los resultados de tu labmate. Finalmente, reproducir los resultados de otro laboratorio.

¿Cómo encontrar un repositorio de datos adecuado?

Navega por Internet durante un par de minutos y echa un vistazo a los repositorios de datos mencionado anteriormente: Figshare, Zenodo, Dryad. Dependiendo de tu campo de investigación, encuentra repositorios reconocidos por la comunidad en tu campo. También puede ser útil estos repositorios de datos recomendados por Nature. Discute con tu vecino qué repositorio de datos deseas abordar para tu proyecto actual y explicale por qué.

¿Puedo publicar código también?

Hay nuevas maneras de publicar código y hacer que sea citable. Uno de ellos se describe en la página principal del mismo GitHub. Básicamente es una combinación de GitHub (donde está el código) y Zenodo (el repositorio que crea el DOI). Lee esta página mientras sabes que ésta es sólo una de las muchas maneras de hacer tu código citable.

Puntos Clave

  • Trabajo científico abierto es más útil y puede ser citado más que si no lo es.